Als Itachi Shisui niet heeft vermoord, hoe heeft hij dan echt zijn Mangekyou Sharingan wakker gemaakt?
De Mangekyou Sharingan wordt geactiveerd zodra de gebruiker een groot verlies ervaart, vooral van iemand die dicht bij hem staat. Dit betekent dat Itachi Shisui niet hoefde te doden om de Mangekyou te activeren. Het belangrijkste voor de activering is dat de gebruiker voelt het verlies, waardoor zijn hersenen een speciaal soort chakra loslaten dat zijn oogzenuwen aantast (hoofdstuk 619), waardoor de Sharingan en de Mangekyou wakker worden, afhankelijk van welk ‘niveau’ je eerder was, en van hoeveel verlies je hebt ervaren. Hoe meer verlies je ervaart, hoe krachtiger de Sharingan wordt.
Waarschijnlijk was alleen al het getuige zijn van Shisui’s dood om het dorp te beschermen traumatisch genoeg voor Itachi om zijn Mangekyou te doen ontwaken. Ook, als je je herinnert, Sasuke’s Mangekyou activeerde toen Itachi died. Hij doodde hem ook niet, maar getuige zijn van zijn dood, ook al haatte hij hem, was traumatisch genoeg om het te activeren.
Dat mag dan waar zijn, maar zo heeft Sasuke zijn Mangekyou Sharingan niet gekregen. In de afleveringen na het gevecht leren we dat Itachi zijn Mangekyou-krachten (Amaterasu, etc.) in Sasuke heeft geïmplanteerd. Die krachten werden geactiveerd toen Sasuke naar Madara’s Sharingan keek; zoals Madara uitlegde, zorgde Itachi ervoor dat de vaardigheden zichzelf activeerden toen ze in contact kwamen met Madara’s Sharingan. Dit was omdat Itachi niet wilde dat Madara en Sasuke elkaar zouden ontmoeten, om te voorkomen dat Madara Sasuke de waarheid over Itachi zou vertellen.